Молекулярно-генетическая диагностика эмбриональных опухолей и сарком у детей
Руководители проекта:
А.Е. Друй - к.м.н., врач клинической лабораторной диагностики НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева
Д.Ю. Качанов - д.м.н., зав. отделением заместитель директора Института онкологии, радиологии и ядерной медицины НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева
А.И. Карачунский - д.м.н., профессор. зам. генерального директора-директор Института онкологии, радиологии и ядерной медицины НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева
Почему этот проект важен?
Детские солидные опухоли групп высокого риска составляют нерешенную проблему детской онкологии: выживаемость больных агрессивной нейробластомой не превышает 30% (менее 10%,
если речь идет об опухолях «ультра-высокого» риска), выживаемость пациентов с метастатическими формами саркомы Юинга и рабдомиосаркомы составляет 15% и 20%, соответственно.
Ежегодно в НМИЦ ДГОИ имени Д. Рогачева госпитализируется около 300 больных, имеющих распространенную опухоль, классифицированную как заболевание высокого риска, согласно
конвенциональным схемам стратификации пациентов. Среди этих пациентов 30-50 пациентов имеют первично-рефрактерное течение заболевания, у 50-70 развивается рецидив или прогрессия
опухоли. При этом, для большинства солидных опухолей детского возраста (саркома Юинга, остеогенная саркома, рабдомиосаркома) отсутствуют куративные (излечивающие) возможности
второй и последующих линий терапии, то есть, пациент, не ответивший на терапию первой линии, не может быть излечен.
Данным пациентам показан поиск потенциально-эффективного экспериментального лечения. К таким видам воздействия относится молекулярно-направленная (таргетная) терапия,
иммунотерапия моноклональными антителами к поверхностным рецепторам, применение ингибиторов иммунных «сверочных точек» и CAR-T – клеточная терапия. При этом многочисленные
исследования показали, что любая молекулярно-направленная терапия эффективна только в случае наличия предиктивного биологического маркера – мишени для таргетного воздействия.
Поиск данных мишеней и является целью данного проекта.
Что мы хотим сделать?
- Внедрить агностический подход к назначению таргетной терапии при выявлении маркера чувствительности к ней
- Улучшить качество и продолжительность жизни пациентов при использовании инновационной терапии в условиях неэффективности стандартной
- При наличии хорошего ответа на таргетную терапию рассмотреть возможность ее использования в качестве излечивающей опции
Цель исследования – поиск генетических аномалий, определяющих чувствительность к молекулярно-направленной терапии у пациентов с солидными
опухолями групп высокого риска
Чего мы хотим достичь?
Запуск проекта позволит создать предпосылки для назначения молекулярно-направленной (таргетной и иммунологической) терапии в клинической практике.
Это приведет к значительному улучшению качества жизни пациентов, проходящих лечение агрессивной, рефрактерной опухоли или рецидива заболевания, за счет
снижения токсичности терапии. В ряде случаев при наличии хорошего ответа на терапию можно будет рассматривать инновационные методы лечения как излечивающую
опцию и рекомендовать ее внедрение в стандартные схемы терапии при выявлении соответствующего предиктивного биомаркера.
Мы планируем участие в исследовании 250-300 пациентов в год.
Чего нам удалось достичь?
Начало включения пациентов в исследование – 14 августа 2020 года
На текущий момент в рамках проекта проведено более 2000 уникальных исследований и обследовано более 900 пациентов.
У 60% данных пациентов найдены значимые генетические нарушения и около 10% пациентов имеют мутации, для которых потенциально существует таргетная терапия.
В настоящее время ежегодно обследуются примерно 300-350 пациентов с использованием высокотехнологичных молекулярно-генетических методов:
- Высокопроизводительное секвенирование ДНК и РНК (NGS) – 194
- Определение экспрессии химерных генов – 181
- Исследование несбалансированных хромосомных аберраций с помощью сравнительной геномной гибридизации и MLPA – 62
- Экспрессионное профилирование с помощью технологии NanoString – 25
- Исследование мутаций с помощью аллель-специфической ПЦР – 44
В рамках проекта осуществлено оснащение лаборатории молекулярной онкологии следующим оборудованием: амплификаторы BioRad C1000, T100, амплификатор
с оптическим детектирующим модулем CFX96, система капиллярного электрофореза Agilent TapeStation 4150, секвенатор MinION, вычислительная техника.
В лаборатории запущена технология полнотранскриптомного секвенирования РНК, позволяющая обнаруживать неописанные и редкие химерные транскрипты,
которые могут быть дифференциально-диагностическими маркерами отдельных видов опухолей или служить мишенями для молекулярно-направленной терапии.
Продолжительность проекта: 2020–2026 гг.
Истории пациентов
Дарина,
Данила