На базе ФГБУ «НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева» Минздрава России действуют два диссертационных совета.

Диссертационный совет 21.1.025.01 принимает к защите диссертационные работы по специальностям: 3.1.6 Онкология, лучевая терапия (медицинские науки); 3.1.21. Педиатрия (медицинские науки); 3.1.28. Гематология и переливание крови (медицинские науки).

Объединенный диссертационный совет 99.1.098.02 создан на базе Центра и ФГБУН ЦТП ФХФ РАН и принимает к защите диссертации по специальностям: 1.5.2. Биофизика (медицинские и биологические науки); 3.3.8. Клиническая лабораторная диагностика (медицинские и биологические науки).

Диссертационный совет 21.1.025.01 (Д 208.050.02) на базе ФГБУ «НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева» Утвержден приказом Министерства образования и науки РФ №508/нк от 24 мая 2017г.

Объединенный диссертационный совет 99.1.098.02 на базе ФГБУН ЦТП ФХФ РАН и ФГБУ «НМИЦ ДГОИ им. Дмитрия Рогачева» Минздрава России утвержден приказом Министерства науки и высшего образования РФ №1690/нк от 07 декабря 2022 г.